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网站快照 M i c r o b i a l B i o i n f o r m a t i c s G r o u p a t M M L , S J T U B i o i n f o r m a t i c s P u b l i c a t i o n P e o p l e H o m e M i c r o b i a l B i o i n f o r m a t i c s G r o u p a t M M L , S J T U N o t e : t h e f o l l o w i n g b i o i n f o r m a t i c s t o o l s / d a t a b a s e a r e u n d e r m a i n t e n a n c e : D e e p S e c E , I C E b e r g 3 a n d I C E f i n d e r 2 , a n d T 4 S E f i n d e r . S o s o r r y ! T h e M i c r o b i a l B i o i n f o r m a t i c s G r o u p a t t h e L a b o r a t o r y o f M o l e c u l a r M i c r o b i o l o g y , S t a t e K e y L a b o r a t o r y o f M i c r o b i a l M e t a b o l i s m , S c h o o l o f L i f e S c i e n c e s a n d B i o t e c h n o l o g y , S h a n g h a i J i a o T o n g U n i v e r s i t y ( S J T U ) , C h i n a , i s f o c u s e d o n i n d e p t h m i n i n g o f b a c t e r i a l g e n o m e s e q u e n c e s b y c o m b i n a t i o n o f b i o i n f o r m a t i c s a p p r o a c h e s a n d m o l e c u l a r b i o l o g y e x p e r i m e n t a l t e c h n i q u e s . T h e c u r r e n t w o r k e m p h a s i z e s : ( i ) d e v e l o p m e n t o f t h e o p e n a c c e s s d a t a b a s e a n d p r e d i c t i o n t o o l s o f b a c t e r i a l m o b i l e g e n e t i c e l e m e n t s , t o x i n a n t i t o x i n s y s t e m s , a n d s e c r e t i o n s y s t e m s ; ( i i ) c h a r a c t e r i z a t i o n o f n o v e l m o b i l e g e n e t i c e l e m e n t s i n K l e b s i e l l a p n e u m o n i a e a n d o t h e r o p p o r t u n i s t i c b a c t e r i a l p a t h o g e n s t h a t h a v e d e v e l o p e d a n t i b i o t i c r e s i s t a n c e s . N e w s : 研 究 生 招 生 : 2 0 2 5 年 研 究 生 招 生 情 况 说 明 ( 学 术 型 硕 士 1 名 ) 学 术 报 告 : 2 0 2 5 年 5 月 , T r a n s f o r m i n g b i o m e d i c i n e w i t h A I : E n a b l i n g d a t a d r i v e n b i o m e d i c a l d i s c o v e r y w i t h m a c h i n e l e a r n i n g t e c h n i q u e s , 宋 江 宁 蒙 纳 士 大 学 科 研 进 展 : 2 0 2 4 年 1 0 月 , 合 作 研 发 预 测 C D 8 + T 细 胞 受 体 识 别 抗 原 表 位 的 新 方 法 科 研 进 展 : 2 0 2 4 年 1 0 月 , 质 粒 接 合 起 始 位 点 数 据 库 o r i T D B 2 论 文 在 N A R 发 表 科 研 进 展 : 2 0 2 4 年 8 月 , 合 作 发 现 转 座 酶 T n p A 通 过 与 肺 炎 克 雷 伯 菌 D n a N 直 接 互 作 来 实 现 T n 1 7 2 1 的 转 座 学 术 报 告 : 2 0 2 4 年 5 月 , T r a n s l a t i o n a l h u m a n o r g a n e x v i v o p e r f u s i o n m o d e l s t o s t u d y i n f e c t i o n , P r o f . M a r c o R . O g g i o n i , U n i v e r s i t y o f B o l o g n a , I t a l y 科 研 进 展 : 2 0 2 4 年 2 月 , 合 作 发 现 R E S X r e 家 族 T A 系 统 K n a A T 维 持 肺 炎 克 雷 伯 菌 毒 力 质 粒 的 遗 传 稳 定 科 研 进 展 : 2 0 2 3 年 1 2 月 , 合 作 发 现 肺 炎 克 雷 伯 菌 从 动 质 粒 促 进 耐 药 基 因 和 毒 力 基 因 的 播 散 科 研 进 展 : 2 0 2 3 年 1 1 月 , D e e p S e c E , I C E b e r g 3 和 T A D B 3 论 文 发 表 科 研 进 展 : 2 0 2 3 年 9 月 , 发 现 肺 炎 克 雷 伯 菌 C p x R 调 控 耐 药 质 粒 中 b l a K P C 基 因 和 t r a 基 因 簇 的 转 录 学 术 报 告 : 2 0 2 3 年 7 月 , 基 于 本 体 的 疫 苗 数 据 标 准 化 、 整 合 和 机 器 学 习 , 何 勇 群 密 西 根 大 学 医 学 院 学 术 报 告 : 2 0 2 3 年 5 月 , 利 用 机 器 学 习 技 术 来 加 速 生 物 医 学 知 识 发 现 , 宋 江 宁 蒙 纳 士 大 学 科 研 进 展 : 2 0 2 2 年 1 1 月 , 发 展 细 菌 六 型 分 泌 系 统 数 据 库 科 研 进 展 : 2 0 2 2 年 5 月 , 发 展 病 原 菌 耐 药 移 动 元 件 的 一 键 式 分 析 软 件 科 研 进 展 : 2 0 2 1 年 1 0 月 , 开 发 细 菌 基 因 组 规 模 预 测 I V 型 分 泌 系 统 效 应 蛋 白 的 新 软 件 科 研 进 展 : 2 0 2 1 年 7 月 , 合 作 发 现 肺 炎 克 雷 伯 菌 毒 力 质 粒 的 非 自 主 转 移 学 术 报 告 : 2 0 2 1 年 5 月 , L e v e r a g i n g t h e p o w e r o f d a t a d r i v e n m a c h i n e l e a r n i n g t e c h n i q u e s t o a d d r e s s s i g n i f i c a n t b i o m e d i c a l c l a s s i f i c a t i o n p r o b l e m s 学 术 报 告 : 2 0 1 9 年 1 0 月 , W i t h i n m a c r o p h a g e s r e p l i c a t i o n d y n a m i c s o f K l e b s i e l l a p n e u m o n i a e 学 术 报 告 : 2 0 1 9 年 1 0 月 , 本 体 : 生 物 医 学 大 数 据 标 准 化 与 高 级 人 工 智 能 的 基 石 学 术 报 告 : 2 0 1 9 年 9 月 , 基 于 纳 米 孔 测 序 技 术 的 新 型 耐 药 质 粒 结 构 解 析 方 案 学 术 报 告 : 2 0 1 9 年 4 月 , R N A S y s t e m s B i o l o g y m e e t s i n f e c t i o n : B a c t e r i a l 3 ’ U T R f r a g m e n t s a r e a n o v e l c l a s s o f r e g u l a t o r y R N A 科 研 进 展 : 2 0 1 9 年 8 月 , 联 合 发 现 与 肺 炎 克 雷 伯 菌 乙 酰 基 转 移 酶 类 毒 素 抗 毒 素 系 统 的 转 录 调 控 机 制 科 研 进 展 : 2 0 1 8 年 7 月 , 明 确 肺 炎 克 雷 伯 菌 耐 药 质 粒 在 高 毒 株 中 的 接 合 转 移 科 研 进 展 : 2 0 1 8 年 3 月 , 肺 炎 克 雷 伯 菌 乙 酰 基 转 移 酶 类 毒 素 抗 毒 素 系 统 的 识 别 和 鉴 定 科 研 进 展 : 2 0 1 7 年 2 月 , V R p r o f i l e 软 件 识 别 病 原 细 菌 的 可 移 动 遗 传 元 件 学 术 报 告 : 2 0 1 6 年 1 0 月 , H i s t i d i n e k i n a s e : t h e r e c e p t o r o f β l a c t a m a n t i b i o t i c s i n G r a m n e g a t i v e b a c t e r i a 学 术 报 告 : 2 0 1 6 年 1 0 月 , S y s t e m a t i c a n d I n t e g r a t i v e B i o i n f o r m a t i c C o l l e c t i o n , R e p r e s e n t a t i o n , a n d A n a l y s i s o f V a c c i n e s a n d P a t h o g e n V i r u l e n c e F a c t o r s 学 术 报 告 : 2 0 1 5 年 8 月 , A S a l m o n e l l a e n t e r i c a P a r a t y p h i A S t k f i m b r i a l g e n e p o l y m o r p h i s m : s p o n t a n e o u s n e u t r a l v a r i a t i o n o r a n i m m u n e e v a s i o n s e l e c t e d p h e n o m e n o n 学 术 报 告 : 2 0 1 5 年 7 月 , F r o m M i c r o o r g a n i s m s : D r u g D e l i v e r y , N a n o t e c h n o l o g y a n d C a n c e r T h e r a p y 科 研 进 展 : 2 0 1 5 年 7 月 , 分 析 碳 青 酶 烯 耐 药 肺 炎 克 雷 伯 菌 的 可 移 动 基 因 组 学 术 报 告 : 2 0 1 5 年 6 月 , M i n i S e m i n a r o n B a c t e r i a l A n t i m i c r o b i a l R e s i s t a n c e ( A M R ) a n d D r u g D e v e l o p m e n t 科 研 进 展 : 2 0 1 1 年 1 0 月 , 细 菌 整 合 性 接 合 元 件 数 据 库 对 外 开 放 科 研 进 展 : 2 0 0 7 年 1 1 月 , 甲 型 副 伤 寒 沙 门 菌 的 多 重 P C R 检 测 C r e a t e d o n J u l y 2 0 1 0 | U p d a t e d o n S e p t 2 0 2 4 沪 交 I C P 备 2 0 1 0 7 5 4
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